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阿利新蓝染色液利用染液的不同pH值可区分粘液物质的类属，pH值为2.5时组织内的羧基电离，带有一个负电荷，与阿利新蓝中的阳离子形成盐键，使带有羧基的组织(如蛋白多糖/透明质酸以及上皮酸性黏蛋白)染色；pH值为1.0时组织内的硫酸根电离，带有一个负电荷，与阿利新蓝中的阳离子形成盐键，使带有硫酸根的组织(如硫酸黏液物质)染色，中性黏蛋白(如胃黏膜和Brunner腺体部位的中性黏蛋白)不能与阿利新蓝反应。

阿利新蓝(Alcian)又称爱先蓝或阿尔辛蓝等，是一种类铜钛花青共轭染料，最初用于纺织纤维染色。这种阳离子染料与酸性基团结合，也即阿尔辛蓝与组织内含有的阴离子基团如羧基和硫酸根形成不溶性复合物，阿利新蓝由中央含铜的酞菁环与四个异硫脲基通过硫醚键相连而成。该异硫脲基呈中度碱性，使阿利新蓝带阳离子。阿利新蓝使碳水化合物着色的确切机制不明，普遍认为是阳离子的异硫脲基通过静电与组织内的多聚阴离子相连，如含羧基和硫酸根的酸性黏液物质的羧基和硫酸根形成不溶性复合物，即染料分子中带正电荷的盐键和酸性黏液物质中带负电荷的酸性基团结合呈蓝色。

• 固定液采用10%中性福尔马林固定液。
  
• 若要选择性鉴别硫酸黏蛋白和蛋白多糖，应使用pH值低(pH=1.0)的阿利新蓝，即调pH值为1.0；染色程序与pH=2.5的阿利新蓝操作相同，染色时间应相应延长。
  
• 已开封试剂应在开封后6个月内使用完，每次用后应及时拧紧瓶盖，以免挥发或变质。
  
• 为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。
  
• 试剂开封后请尽快使用，以防影响后续实验效果。

• 二甲苯或脱蜡透明液脱蜡，通过梯度乙醇后，入蒸馏水再水化。
  
• 入阿利新蓝染色液(pH2.5)染色15～30min，流水冲洗5min。
  
• 入核固红染色液复染10min，流水冲洗1min。
  
• 梯度乙醇脱水，二甲苯或脱蜡透明液透明，中性树胶封片。